Второй сезон «Восставшего против неба» начинается с того, что Фан Юань, наконец, обретает долгожданную свободу. Сбежав из-под гнета клана Шан и сбросив оковы своего прошлого тела, он оказывается в мире, где его имя уже стало легендой. Однако эта свобода — иллюзия. Небесный суд, почувствовав угрозу, активирует древний механизм — «Чистилище Мириадов Душ». Эта ловушка затягивает Фан Юаня в искусственно созданное измерение, где время течет иначе, а каждый шаг подчинен воле Небесного Дао. Здесь он сталкивается с эхом прошлых эпох — призраками тех, кто тоже когда-то пытался бросить вызов небесам. Их останки, воля и даже фрагменты их техник служат инструментами для испытания. Фан Юань понимает: это не просто тюрьма, а экзамен. Небеса хотят сломать его дух, заставив снова и снова переживать моменты собственных неудач и предательств. Но вместо раскаяния он находит в этих иллюзиях новые возможности. Используя свой циничный ум и хладнокровие, он начинает разбирать «Чистилище» на части, превращая ловушку в источник силы.
Тем временем внешний мир погружается в хаос. Смерть старого Небесного Императора, подстроенная Фан Юанем в финале первого сезона, открыла вакуум власти. Различные секты и древние кланы, ранее скрывавшиеся в тени, начинают открытую войну за трон. Главный советник императора, мудрец Ван Юань, подозревая, что за всем стоит сбежавший бессмертный, собирает коалицию для охоты на Фан Юаня. Однако его планы рушатся, когда выясняется, что часть высших чинов Небесного суда тайно поддерживает Фан Юаня. Они видят в нем инструмент для свержения старого порядка, который давно прогнил. В этой шахматной партии Фан Юань, запертый в измерении, умудряется манипулировать событиями снаружи через подставных лиц и заложенные ранее артефакты. Он заключает временный союз с демоническим культом, который обещает ему доступ к запретной библиотеке «Изначальной Пустоты» в обмен на уничтожение одного из Небесных Стражей. Но цена этого союза высока — Фан Юань теряет часть своей бессмертной души, что делает его уязвимым для атак, направленных на сущность, а не на тело. В финальных эпизодах сезона он вырывается из «Чистилища», но не как прежний хитрый стратег, а как существо, наполовину слившееся с самой тканью Дао. Его глаза теперь видят не только линии судьбы, но и «трещины» в реальности — места, где Небеса слабы. Он выходит навстречу армии Ван Юаня, но вместо битвы предлагает сделку: он не будет уничтожать мир, если ему позволят взойти на «Трон Пустоты» — мифический артефакт, дающий власть переписывать законы мироздания. Сезон обрывается на том, что Фан Юань, истекая черной кровью, вступает на первую ступень лестницы к трону, а за его спиной рушатся небесные врата, открывая дорогу в мир, где нет ни богов, ни судьбы.
